‘헌드레드’란 ―― 지구를 공격하는 수수께끼의 생명체 ‘새비지’에 대항할 수 있는 유일한 무기를 뜻한다. 주인공 키사라기 하야토는 바로 그 헌드레드를 사용하는 ‘무예자 (슬레이어) ’가 되는 것을 목표로 해상 학원 도시함 ‘리틀가든’에 입학한다. 그러나―― “보고 싶었어. 하야토!!” “너, 너는 도대체……!!” 어찌 된 영문인지 자신에 대해 자세히 알고(?) 있는 룸메이트 에밀 크로스포드에게 낯익은 위화감을 느끼는 하야토. 게다가 입학하자마자 학원 최강의 무예자인 ‘여왕’ 클레어 하베이가 결투를 신청하는데……?!